Ранее мы сообщали, что ИГУ вошел в топ-10 среди вузов России по количеству победителей в конкурсе фонда Потанина для преподавателей магистратуры. Четыре представителя ИГУ стали победителями.

Сегодня расскажем о проекте кандидата технических наук, доцента кафедры естественнонаучных дисциплин факультета бизнес-коммуникаций и информатики ИГУ Ивана Петрушина «Модернизация курса по применению инструментов биоинформатики для анализа геномных данных».

Иван Петрушин:

В программу магистратуры института математики и информационных технологий ИГУ по профилю «Анализ данных научных экспериментов и машинное обучение» включён курс «Биоинформатика». За 5 лет существования магистратуры появились новые методы в отрасли, важную роль стали играть технологии искусственного интеллекта, и мы приняли решение обновить этот курс. В команде проекта вместе со мной – аспирант Лимнологического института СО РАН Дарья Гутник и выпускник упомянутой выше магистратуры, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник  СИФИБР СО РАН Игорь Горбенко. Вместе мы ведём ряд исследований и постоянно используем инструменты биоинформатики в своей работе.

Модернизируемый курс направлен на изучение широкого спектра инструментов биоинформатики и специализированных библиотек для обработки и интерпретации геномных данных на языках R и Python. Основная аудитория курса - магистранты профиля «Анализ данных научных экспериментов и машинное обучение», но модули курса могут быть использованы для подготовки аспирантов и создания программ повышения квалификации. Область вычислительной биологии и биоинформатики тесно связана биомедициной, селекцией, экологией и биотехнологией. 

Аналогичные курсы практически не представлены в программах вузов России. Для изучения инструментов биоинформатики обычно существуют специализированные магистерские программы, в которых эти темы распределены по нескольким дисциплинам. Обучение по таким программам требует знаний предметной области (молекулярной биологии и генетики).

Обновлённый курс будет состоять из 6 модулей, содержащих видео-материалы с лекциями и инструкциями для практических заданий. В таком формате курс может быть изучен очно или дистанционно с преподавателем, а также в режиме самоподготовки.